Resumen Se analiza el aumento del nivel del mar tomando como base el nivel promedio de mareas altas para la región Caribe de Costa Rica. Este estudio se realizó a partir de modelos conceptuales, observaciones y mediciones efectuadas en campo, que presentan un nivel del mar y su respectivo ascenso para cuatro escenarios de acuerdo con los siguientes años: 2030, 2050, 2070 y 2100. Se elaboran escenarios para simular el comportamiento del nivel del mar relativo en los próximos 100 años para las localidades de Cahuita y Moín en la provincia de Limón. Se estudian los niveles de mareas astronómicas a partir de predicciones mareales. El aumento del nivel del mar en los próximos años por calentamiento global es, según los escenarios de la CEPAL (2012, p. 24), 3 mm por año para la costa del Caribe en general y se utiliza como base para crear las distintas combinaciones y generar los niveles mareográficos representados en este artículo. Los resultados muestran los niveles de inundación para cada uno de los años en las localidades de Moín y Cahuita e indica que ambas localidades podrían ser inundadas para el año 2100.

Abstract Sea level rise is analyzed based on the average level of high tides registered for the Caribbean region of Costa Rica. The present study utilized conceptual models, field observations and field measurements, which provide sea level data and its respective rise, for the modelling of possible scenarios for four different years: 2030, 2050, 2070 and 2100. Scenarios were developed to simulate the behavior of the relative sea level in the next 100 years for the localities of Cahuita and Moín, both in the province of Limón, Costa Rica. Astronomical tidal levels are studied from tidal predictions. The rise in sea level in the coming years due to global warming is, according to ECLAC scenarios/predictions CEPAL (2012, p. 24), 3 mm per year for the Caribbean coast in general and is used as a basis for the creation of the different combinations and generation of the tidal levels represented in the present article. Results show flood levels for each considered year and indicate that both Moín and Cahuita could be flooded by the year 2100.

Resumo Fluoroquinolonas são agentes antimicrobianos importantes para o tratamento de infecções por Pseudomonas. Um total de 11 bacilos isolados de P. aeruginosa foram coletados de diferentes amostras clínicas provenientes de diferentes centros médicos na Cisjordânia-Palestina durante o ano de 2017. Neste estudo, resistência a fluoroquinolonas e secreções de β-lactamases foram detectadas por métodos fenotípicos, enquanto a presença de sequências do gene β-lactamase e outros fatores de virulência foram detectados pela técnica de PCR (Proteína C-reativa). O produto de PCR para os genes gyrA, parC e parE foram sequenciados para análises posteriores. As análises filogenéticas, os índices de diversidade populacional e a determinação de haplótipos foram realizados utilizando os softwares MEGA versão 6, DnaSP 5.1001 e o algoritmo de junção de mediana do programa Network 5, respectivamente. Os resultados deste estudo mostraram que a MIC para ciprofloxacina e norfloxacina tinha um intervalo de 32-256 µg/ml. Além disso, todos os bacilos isolados carregavam genes exoT ou exoT e exoY, genes de β-lactamase diferentes e 82% desses isolados continham integrons de classe 1. As análises das sequências gyrA, parC e parE foram consideradas polimórficas, com alta diversidade de haplótipos (0,945-0,982), baixa diversidade de nucleotídeos (0,01225-0,02001) e o número de haplótipos foi de 9 para cada gene de gyrA e parE e 10 haplótipos para o gene parC. Os haplótipos fundadores são Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) e Hap-6 (9,1%) para os genes gyrA, parC e parE, respectivamente. Dois dos haplótipos parE foram detectados como haplótipos InDel. As redes Median-joining (MJ) construídas a partir de haplótipos desses genes mostraram uma expansão semelhante à de uma estrela. Os testes de neutralidade (teste D de Tajima e teste Fs de Fu) para esses genes apresentaram valores negativos. As cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas mostraram alto nível de MIC para fluoroquinolonas, produtores de β-lactamase, genes codificadores de exotoxina de secreção tipo III, a maioria deles tinha o gene integrase I e tinha alto nível de mutações nas regiões QRDR nos genes gyrA, parC e parE. Todos esses fatores podem desempenhar um papel importante na invasão dessas cepas e torná-las difíceis de tratar. O isolamento dessas cepas em diferentes centros médicos, indica a necessidade de uma aplicação estrita de medidas de controle de infecção em centros médicos da Cisjordânia-Palestina que visam reduzir despesas e danos causados por infecções por P. aeruginosa. As análises moleculares mostraram que os haplótipos de P. aeruginosa resistentes à fluoroquinolona palestina não são geneticamente diferenciados; no entanto, mais mutações podem existir nessas cepas.

Abstract Fluoroquinolones are important antimicrobial agents for the treatment of Pseudomonas infections. A total of 11 isolates of P. aeruginosa were collected from different clinical samples from different medical centers in the North West Bank-Palestine during 2017. In this study, resistance to fluoroquinolones and secretions of β-lactamases were detected by phenotypic methods, while presence of β-lactamase gene sequences and other virulence factors were detected by PCR technique. PCR product for gyrA, parC and parE genes were sequenced for further analyses. The phylogenetic analyses, population diversity indices and haplotypes determination were conducted using computer programs MEGA version 6, DnaSP 5.1001 and median-joining algorithm in the program Network 5, respectively. Results of this study showed that the MIC for ciprofloxacin and norfloxacin had a range of 32-256 µg/ml. In addition, all isolates carried either exoT or exoT and exoY genes, different β-lactamase genes and 82% of these isolates harbored class 1 integrons. Analyses of the gyrA, parC and parE sequences were found to be polymorphic, had high haplotype diversity (0.945-0.982), low nucleotide diversity (0.01225-0.02001) and number of haplotypes were 9 for each gyrA and parE genes and 10 haplotypes for parC gene. The founder haplotypes being Hap-1 (18%), Hap-2 (27.3%) and Hap-6 (9.1%) for gyrA, parC and parE genes, respectively. Two of ParE haplotypes were detected as indel haplotypes. The Median-joining- (MJ) networks constructed from haplotypes of these genes showed a star-like expansion. The neutrality tests (Tajima’s D test and Fu’s Fs test) for these genes showed negative values. Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa strains showed high MIC level for fluoroquinolones, β-lactamase producers, carried type III secretion exotoxin-encoding genes, most of them had integrase I gene and had high level of mutations in QRDR regions in gyrA, parC and parE genes. All these factors may play an important role in the invasiveness of these strains and make them difficult to treat. Isolation of these strains from different medical centers, indicate the need for a strict application of infection control measures in Medical centers in the North West Bank-Palestine that aim to reduce expense and damage caused by P. aeruginosa infections. Molecular analyses showed that Palestinian fluoroquinolone resistant P. aeruginosa haplotypes are not genetically differentiated; however, more mutations may exist in these strains.

Resumen La marchitez vascular del jitomate (Solanum lycopersicum L.) es una de las enfermedades más importantes que afecta la producción alrededor del mundo. El control biológico ha emergido como una de las alternativas más promisorias al uso de fungicidas químicos. El objetivo de esta investigación fue diagnosticar el agente causal de la enfermedad y probar la efectividad in vitro de compuestos comerciales biológicos, botánicos y químicos contra el patógeno. Se realizó el aislamiento monospórico del hongo, se extrajo y amplificó el ADN de las regiones ITS1 e ITS2 del ADN ribosomal y del fragmento del gen del factor de elongación de la traducción (TEF-1α). Las secuencias se compararon con las reportadas en la base del NCBI mediante el software BLAST-N. En el Ensayo I se evaluó la efectividad contra el patógeno de los metabolitos difusibles en PDA de las cepas nativas Trichoderma sp. y T. asperellum, además de las comerciales T. virens G-41 y T. harzianum. En el Ensayo II se evaluó in vitro la fungitoxicidad de pesticidas químicos y botánicos contra el hongo. Ambos ensayos se realizaron usando un diseño completamente al azar, con cuatro repeticiones. Se realizó el ANOVA y la prueba de Tukey (P = 0.05). Se identificó al agente causal como Fusarium solani. Los controladores Trichoderma sp. y T. virens G-41 presentaron la máxima efectividad, con 77.19 y 77.81 % de reducción del crecimiento micelial del hongo. Zineb, extracto de canela, neem y ajo redujeron entre 30 y 43.75 % el crecimiento del patógeno. Comparativamente, el oxicloruro de cobre, captan, carbendazim, mancoceb y benomilo controlaron 100 % a F. solani. Se concluye que los pesticidas biológicos y botánicos actúan como fungistáticos contra F. solani y los fungicidas de contacto son efectivos para suprimir el crecimiento del patógeno.

Summary The vascular wilt of tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the most important diseases that affect production around the world. Biological control has emerged as one of the most promising alternatives to the use of chemical fungicides. The aim of this research was to diagnose the causative agent of the disease and to test the in vitro effectiveness of commercial biological, botanical and chemical compounds against the pathogen. Monosporic isolation of the fungus was performed, the DNA was extracted and amplified from the ITS1 and ITS2 regions of the ribosomal DNA and from the gene fragment of the translation elongation factor (TEF-1α). The sequences were compared with those reported in the NCBI database using BLAST-N software. In Trial I, the effectiveness against the pathogen of diffusible metabolites in PDA of the native Trichoderma sp. and T. asperellum, in addition to the commercial T. virens G-41 and T. harzianum. In Test II, the fungitoxicity of chemical and botanical pesticides against the fungus was tested in vitro. Both trials were conducted using a completely randomized design with four repetitions. The ANOVA and the Tukey test (P = 0.05) were performed. The causative agent was identified as Fusarium solani. Trichoderma sp. and T. virens G-41 caused the highest percentage of fungal mycelial growth inhibition, with 77.19 and 77.81%. Zineb, extract of cinnamon, neem and garlic reduced pathogen growth by 30 to 43.75 %. Comparatively, cooper oxiclorure, captan, carbendazim, mancozeb and benomilo had a 100 % control over F. solani. It is concluded that biological and botanical pesticides act as fungistatics against F. solani and contact fungicides are effective to suppress the growth of the pathogen.

Resumo A eficácia hemostática de diferentes tipos de extrato de Satureja thymbra L., Thymbra spicata L. (Lamiaceae) e Verbascum fruticulosum Post. (Scrophulariaceae) foi avaliada neste estudo pelo tempo de protrombina (TP) e tempo de tromboplastina parcial ativada (TTPa). Os extratos aquosos, metanólicos e etanólicos das folhas das espécies de plantas examinadas foram preparados para uma concentração final de 50 mg/mL. Os ensaios de TP e TTPa in vitro foram realizados em amostras normais de sangue, pobre em plaquetas, por um analisador de coagulação digital. Os resultados obtidos revelaram atividade anticoagulante de todas as espécies de plantas investigadas, com variações observadas dentre elas. Os extratos aquosos e etanólicos de T. spicata e o extrato aquoso de S. thymbra prolongaram significativamente os valores de TP (p <0,05). Entretanto, todos os tipos de extratos de V. fruticulosum não tiveram efeito significativo sobre os valores de TP. Os dados registrados do TTPa mostraram que todos os extratos aquosos tiveram um efeito significativo na hemostase do sangue, pois aumentaram os valores de TTPa em todas as espécies de plantas em estudo. Dos quais, ambos os extratos etanólicos e metanólicos de T. spicata e o extrato metanólico de S. thymbra mostraram efeito semelhante. De grande preocupação, notou-se claramente que os extratos aquoso e etanólico de T. spicata e o extrato aquoso de S. thymbra apresentam efeito anticoagulante mais forte, aumentando os valores de TP e TTPa significativamente em relação ao controle (p <0,05). A variável bioatividade anticoagulante dentre as espécies vegetais estudadas pôde ser referida aos vários graus de solventes de solubilidade de diferentes fitoconstituintes. Assim, a eficácia da avaliação de extratos de espécies vegetais como anticoagulantes ou coagulantes foi relacionada às espécies vegetais e ao solvente de extração.

Abstract The haemostatic efficacy of different extract types of Satureja thymbra L., Thymbra spicata L. (Lamiaceae) and Verbascum fruticulosum Post. (Scrophulariaceae) was evaluated in this study via the Prothrombin time (PT) and Activated partial thromboplastin time (aPTT) analysis. Aqueous, methanol and ethanol extracts of the examined plant species leaves were prepared to a final concentration 50 mg/mL. In vitro PT and aPTT assays were conducted on normal platelet poor plasma blood samples by a digital coagulation analyzer. The obtained results revealed anticoagulation activity of all investigated plant species with observed variations among them. The aqueous and ethanol extracts of T. spicata as well as the aqueous extract of S. thymbra prolonged PT values significantly (p < 0.05). While, all V. fruticulosum extract types have had no significant effect on the PT values. The recorded aPTT data showed that all aqueous extracts have had a significant effect on the blood haemostasis as they increased aPTT values in all plant species under study. Out of which, both the ethanol and methanol extracts of T. spicata and methanol extract of S. thymbra showed similar effect. Of great concern, it was clearly noticed that the aqueous and ethanol extract of T. spicata and the aqueous extract of S. thymbra possess the strongest anticoagulation effect as they increased both PT and aPTT values significantly relative to the control (p < 0.05). The variable anticoagulation bioactivity among the studied plant species could be referred to the various solvents degrees of solubility of different phyto-constituents. Thus, the efficacy of the plant species extracts evaluation as anticoagulants or coagulants were related to the plant species and to the solvent of extraction.

Resumen Introducción: Para Costa Rica, los estudios realizados en el Pacífico Tropical Este o PTE son importantes ya que se relacionan con el Corredor Marino del Pacífico Este Tropical, el cual es un esfuerzo de conservación multinacional. El presente estudio describe los parámetros físicos de temperatura del mar y salinidad del océano de las masas de agua que rodean a la Isla del Coco y su entorno, el PTE, a través del análisis de perfiles de CTD obtenidos durante campañas hidrográficas realizadas entre el año 2008 y el 2012; y comparar los resultados de los datos in-situ con los del reanálisis del modelo HYCOM-NCODA. Métodos: Se compilaron los resultados de 8 diferentes campañas científicas a la Isla del Coco de abril de 2008, marzo de 2009, abril de 2010, julio de 2011 y marzo de 2012. También se analizan las campañas de octubre de 2010 y marzo de 2011 en donde se realizó un transecto latitudinal y un transecto longitudinal en las aguas del Pacífico Tropical Este de Costa Rica. En julio de 2012 se realizaron 3 transectos latitudinales en las aguas en torno a la Isla del Coco. Las mediciones se hicieron por medio de un CTD, instrumento utilizado para determinar la conductividad, temperatura y presión de la columna de agua, entre otras variables. Resultados: Se observó la presencia de Agua Superficial Tropical en los primeros 50m de profundidad, con temperaturas superiores a 25°C y salinidades menores 33psu y Agua Sub-superficial Sub-tropical bajo los 60m con temperaturas menores a 25°C y salinidades alrededor de las 35ups. La zona de transición entre ellas se presentó entre los 50-60m. Los resultados de la temperatura del mar y la salinidad de los transectos analizados reflejan las condiciones climáticas y atmosféricas observadas, en donde se nota que las variaciones estacionales en el PTE están fuertemente influenciadas por la migración meridional de la Zona de Convergencia Inter-Tropical. Conclusiones: El estudio mostró que los datos del reanálisis del modelo de circulación general HYCOM-NCODA son comparables con los resultados de los perfiles del CTD en el PTE. La distribución de la temperatura de los muestreos tiende a ser similar a los datos del modelo oceánico y las principales diferencias se dan en la capa profunda para la salinidad, por lo que el modelo HYCOM es capaz de reproducir las características observadas en el PTE de temperatura y salinidad y puede ser usado para estudiar la dinámica tropical oceánica, en regiones más extensas y en otras épocas del año.

Abstract Introduction: In Costa Rica, studies done in the Eastern Tropical Pacific or ETP are important because of their interaction/relationship with the Eastern Tropical Pacific Seascape, a known multinational conservation initiative. The present study describes the physical parameters of sea temperature and salinity around Cocos Island and its environment, the ETP, using CTD profiles. Methods: Data were obtained in April 2008, March 2009, April 2010, July 2011 and March 2012 near this island. Latitudinal and longitudinal transects were also done during October 2010 and March 2011 in a broader Costa Rican ETP region. In July 2012, three latitudinal transects were done around Cocos Island. Records were obtained using a CTD, measuring conductivity, temperature and pressure, among other variables. Results: Tropical Surface Water was observed in the upper 50m, showing temperatures above 25°C and salinities below 33psu. Below the surface waters, Subsurface Subtropical Water was detected below a 60m depth, showing temperatures colder than 25°C and salinities around 35psu. The transition between these waters was around 50-60m in depth. Temperature and salinity results were related with the atmosphere conditions observed, in which ETP variability was strongly influenced by the Inter Tropical Convergence Zone migration. Conclusions: This study also showed that reanalysis data from the HYCOM-NCODA general circulation model are comparable and in a good agreement with the CTD profiles. Temperature and salinity HYCOM data also reproduced, in general terms, the main characteristics of CTD data, having some small differences in the deeper levels. This reanalysis data set could also be used to study the tropical ocean dynamics, in wider ETP regions and for different seasons.

Abstract: The in vitro propagation of two cultivars of grapevine (Vitis vinifera L.) Cabernet Sauvignon and Merlot, began using axillary buds and meristems as explants source, these were established in Murashige and Soog (MS) medium plus 6-benzylamino purine (BAP) at 0.5, 1.0 and 1.5 mg L-1. The variables evaluated were number and length of buds. The greatest response was provided with 1.0 mg L-1 of BAP in both explants. For multiplication and shoot rooting, explants were subcultured on MS medium at 50 and 100% and added with 0.5 and 1.0 mg L-1, 0.5 mg L-1 indolebutyric acid (IBA) and vitamins. The best response for bud numbers was 6.37, while for shoot length 2.72 cm, both in the MS medium at 50% with 1.0 mg L-1 of BAP. The highest value obtained for number and length of roots was in MS medium at 50% with 0.5 mg L-1 BAP that obtained 100% rooting in both cultivars.

Resumen: La propagación in vitro de dos cultivares de vid (Vitis vinifera L.), Cabernet Sauvignon y Merlot, se inició utilizando yemas axilares y meristemos como fuente de explante, éstos se establecieron en medio de cultivo Murashige y Skoog (MS) más 6-bencilaminopurina (BAP) al 0.5, 1.0 y 1.5 mg L-1. Las variables evaluadas fueron: número y longitud de brotes. La mayor respuesta se presentó con 1.0 mg L-1 de BAP en ambos explantes. Para la etapa de multiplicación de brotes y enraizamiento fueron subcultivados los explantes en medio de cultivo MS al 50 y 100% adicionados con 0.5 y 1.0 mg L-1 de BAP, más 0.5 mg L-1 ácido indol-3-butírico (AIB) y vitaminas. La mejor respuesta para número de brotes fue de 6.37, mientras que para longitud de brotes de 2.72 cm, ambos en el medio MS al 50% con 1.0 mg L.1 de BAP. Los valores más altos obtenidos para número y longitud de raíces fueron en el medio MS al 50% adicionado con 0.5 mg L-1 de BAP donde se obtuvo el 100% de enraizamiento en ambos cultivares.

Introducción. Las proteínas salivales de los mosquitos son capaces de inducir la producción de anticuerpos, lo que a su vez refleja el grado de contacto hombre-vector. Además, los anticuerpos IgG contra el virus del dengue son indicadores de una exposición previa a este virus. El riesgo de transmisión del virus del dengue está asociado no solo con factores relacionados con la biología del mosquito, o factores virales, sino también, con factores socioeconómicos, como la disponibilidad de agua en el hogar, que pueden desempeñar un papel importante durante la temporada epidémica. Objetivo. Determinar el efecto de la presencia de mosquitos Aedes aegypti en las casas y la exposición previa al virus del dengue, sobre los niveles de anticuerpos contra mosquitos en el contacto humano-vector en habitantes de un área endémica de Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio piloto de 58 casas y 55 participantes en Norte de Santander, Colombia. Se empleó un cuestionario para recopilar la información sobre los factores socioeconómicos y se examinaron las casas para detectar la presencia de sitios de cría de Ae. aegypti . Se recolectó una muestra de sangre humana total en papel de filtro y se estableció el nivel de anticuerpos IgG contra el virus del dengue, además del de los anticuerpos IgG e IgM anti- Ae. aegypti de extracto de glándula salival mediante ELISA. Resultados. Los resultados revelaron un mayor nivel de anticuerpos IgG de extracto de glándula salival en sujetos que vivían en casas con presencia de mosquitos Ae. aegypti en la fase acuática. Asimismo, se encontró una mayor concentración de anticuerpos IgG de extracto de glándula salival en personas previamente expuestas al virus del dengue. Los resultados evidenciaron una correlación positiva significativa entre los niveles de IgM de extracto de glándula salival y los de IgG anti-virus del dengue de extracto de glándula salival, y una correlación negativa con los de IgG de extracto de glándula salival , aunque esta última no fue significativa. Conclusión. La concentración de anticuerpos fue mayor en quienes vivían en casas con estadios acuáticos de Ae. aegypti , como también en las personas con anticuerpos IgG anti-virus del dengue.

Introduction: Mosquito salivary proteins are able to induce an antibody response that reflects the level of human-vector contact. IgG antibodies against dengue virus (DENV-IgG) are indicators of previous exposure. The risk of DENV transmission is not only associated to mosquito or dengue factors, but also to socioeconomic factors that may play an important role in the disease epidemiology. Objective: To determine the effect of the presence of Aedes aegypti mosquitos in different stages in households and the history of dengue exposure on vector-human contact determined by the level of anti-salivary protein antibodies in people living in a Colombian endemic area. Materials and methods: A pilot study of 58 households and 55 human subjects was conducted in Norte de Santander, Colombia. A questionnaire for socioeconomic factors was administered and houses were examined for the presence of Ae. aegypti specimens in the aquatic stages. The level of DENV-IgG antibodies (DENV-IgG), in addition to IgG and IgM anti- Ae. aegypti salivary gland extract (SGE) antibodies (SGE-IgG, SGE-IgM) were evaluated by ELISA using blood collected in filter paper. Results: We found a significant higher level of SGE-IgG antibodies in subjects living in houses with Ae. aegypti in aquatic stages. We also found a higher concentration of SGE-IgG antibodies in people exposed to DENV, a positive correlation between IgM-SGE and IgG-DENV and a negative correlation with IgG-SGE. Conclusion: Anti-salivary proteins antibodies are consistent with the presence of Ae. aegypti aquatic stages inside houses and DENV-IgG antibodies concentrations.

Jatropha curcas is a species with a biodiesel production potential. The supply of elite planting material is critical due to traditional spread disadvantages. Plant tissue culture is an alternative to obtain quality plant material for planting. For these reasons, the objective of this study was to evaluate the feasibility of three phenological ages of petioles (1st, 2nd and 3rd node), and the effect of polyvinylpyrrolidone (PVP) on explants viability of the INI-3 and INI-6 genotypes of J. curcas and the petioles morphogenetic expression of the INI-6 genotype in two culture media (Yasuda and MS) with different doses of TDZ, BA and AIB. The in vitro establishment evaluated the PVP of the INI-3 and INI-6 genotypes with a completely randomized design (CRD) in a 2x2 factorial arrangement and 90 repetitions per treatment. The evaluated variables were viability and callus presence; viability was assessed with the Chi-square test (X²) and the callus weight by an ANOVA. During the induction stage, two media culture added with TDZ, BA and AIB were evaluated in the INI-6 genotype due to their increased viability, in a DCA with a 2x2x2x3 factorial arrangement. Three replications, where the evaluated variable was the callus presence, using a logistic regression analysis (LRA). The results show that the viability is independent from the genotype, according to the X² value (p=0.700), but dependent of the petiole type (p=0.019) and PVP addition (p = 0.001). The presence and callus production were influenced by the genotype expressed in the X² and callus weight by an ANOVA. The induction stage showed that the AIB and TDZ are related to the callus presence based on the LRA.

Jatropha curcas es una especie con potencial para elaborar biodiésel y el suministro de material elite para siembra es crítico debido a desventajas de propagación tradicional. El cultivo de tejidos vegetales es una alternativa para obtener material vegetal de calidad para siembra. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar la viabilidad de tres edades fenológicas de peciolo (1.er, 2.° y 3.er nudo), así como el efecto de la polivinilpirrolidona (PVP) sobre la viabilidad de explantes de los genotipos INI-3 e INI-6 de J. curcas y la expresión morfogénica de peciolos del genotipo INI-6 en dos medios de cultivos (Yasuda y MS) con diferentes dosis de TDZ, BA y AIB. El establecimiento in vitro evaluó la PVP en genotipos INI-3 y INI-6 con un diseño completamente al azar (DCA) con arreglo factorial 2x2 y 90 repeticiones por tratamiento. Las variables evaluadas fueron viabilidad y presencia de callo; la viabilidad se evaluó por prueba de Ji-cuadrada (X²) y el peso del callo por ANDEVA. En la etapa de inducción se analizaron dos medios de cultivo adicionados con TDZ, BA y AIB en explantes del genotipo INI-6 debido a su mayor viabilidad, en un DCA con arreglo factorial 2x2x2x3, tres repeticiones, donde la variable evaluada fue presencia de callo mediante un análisis de regresión logística (ARL). Los resultados mostraron que la viabilidad es independientes del genotipo, de acuerdo al valor de X² (p=0.700), pero dependiente del tipo de peciolo (p=0.019) e incorporación de PVP (p=0.001). La presencia y producción de callo fueron influenciadas por el genotipo expresado en el X² y peso de callo por un ANOVA. La etapa de inducción mostró que el AIB y TDZ están relacionados con la presencia de callo con base en el ARL.

Charcoal rot caused by Macrophomina phaseolina is an important disease of sugarcane in Mexico. This study was carried out to characterize isolates of M. phaseolina obtained from sugarcane by the combination of morphological and molecular analyses. The morphological characterization of 10 isolates was performed using scanning electron microscopy and light microscopy. To confirm the morphological identification, rDNA from two representative isolates was extracted, and the internal transcribed spacer (ITS) region was amplified by polymerase chain reaction and sequenced using specific primers MpKF1 and MpKR1. Based on their morphological characteristics, all isolates were identified as M. phaseolina. Moreover, the analysis of two ITS sequences showed 100 % similarity with the M. phaseolina sequences deposited in the GenBank. To our knowledge, this is the first study in the world aimed at characterizing isolates of M. phaseolina obtained from sugarcane.

La pudrición carbonosa, causada por Macrophomina phaseolina, es una enfermedad importante de la caña de azúcar en México. Este estudio se realizó con el objetivo de caracterizar aislados de M. phaseolina obtenidos de caña de azúcar mediante análisis morfológicos y moleculares. La caracterización morfológica de 10 aislados se llevó a cabo con el uso de microscopia electrónica de barrido y microscopia de luz. Para confirmar la identificación, se extrajo el ADNr de 2 aislados representativos, y la región del espaciador interno transcrito (ITS) se amplificó mediante la reacción en cadena de la polimerasa y se secuenció usando los iniciadores específicos MpKF1 y MpKR1. Los aislados se identificaron como M. phaseolina con base en la morfología. El análisis de secuencias ITS mostró 100 % de similitud con las secuencias de M. phaseolina depositadas en el GenBank. Para nuestro conocimiento, este es el primer estudio del mundo enfocado a caracterizar aislados de M. phaseolina obtenidos de caña de azúcar.

Resumen Se estudió la dinámica de las mareas y el oleaje frente al Humedal Nacional Térraba-Sierpe (HNTS) y su relación con los procesos de erosión y la muerte del manglar en esta región. Se encuentra que un aumento relativo del nivel del mar, ya sea generado por el basculamiento de las costas, o por calentamiento global, es el responsable de crear una nueva plataforma para el oleaje y está modificando el perfil de la costa y cambiando el tipo de sedimento sobre el cual crece el manglar. Una mayor deposición de sedimentos sobre la región norte de este delta, mantiene el equilibrio de este sistema en esta zona, donde más bien hay una ganancia de sedimentos en la isla al frente de la desembocadura del Río Grande de Térraba. Un menor aporte de sedimentos del Rio Sierpe está generando una migración tierra adentro de este sistema estuarino frente a esta región, lo cual es un síntoma de un aumento relativo del nivel del mar. Los escenarios futuros sobre una mayor energía del oleaje, y de un continuo aumento del nivel del mar, no permitirán un equilibrio en la dinámica de los sedimentos, especialmente sobre la parte sur de este delta, por lo que continuará perdiendo la cobertura del manglar en este sistema estuarino.

Abstract The Térraba-Sierpe Reserve has the largest mangrove in Costa Rica but has suffered from changes in sea level. I used published data to analyze the area and found that sea level rise, generated by coast subsidence or global warming, created a new platform for waves and changed the beach profile and sediment type. Increased sediment deposition on the north maintains the balance of this system, with a sediment gain on the island in front of the Térraba river mouth. A lower sediment output from the Sierpe river is generating a landward delta migration, especially in the southern part, a symptom of local sea level rise. Future scenarios of greater wave energy and additional sea level rise will not allow a dynamic sediment balance, especially on the southern part of the delta, and will generate a loss mangrove cover. Rev. Biol. Trop. 63 (Suppl. 1): 29-46. Epub 2015 April 01.

The catalyst-free sonogel route has been implemented to fabricate highly pure SiO2 glasses as host materials for CdTe quantum dot nanocrystals synthesized in aqueous solution. Developed CdTe-based inorganic-inorganic hybrid composites exhibited rigid bulk structures with controllable geometrical shapes and dopant concentrations, allowing the control of the optical properties in the solid-state confinement. Comprehensive linear and nonlinear photophysical characterizations were performed according to UV-vis absorbance, Raman and photoluminescent spectroscopies; the linear refractive indices of highly/lowly CdTe-doped samples were also estimated according to the Brewster angle technique. Since the hybrid glasses are amorphous in nature, the cubic nonlinear optical activity of these composites has been tested via the Z-Scan technique. Results show that the CdTe quantum dots were homogeneously embedded within the SiO2-sonogel matrix with only small guest-host molecular interactions and preserving their strong photoluminescent properties; thus providing advanced solid-state heterostructured nanocomposite materials suitable for current technological photonic applications.

La mayoría de las playas de Costa Rica, tanto en el Pacífico incluyendo la Isla del Coco, como en el Caribe, experimentan procesos de erosión. Algunos lugares que se encuentran en playas abiertas muestran erosión más acelerada y requieren acción inmediata, mientras que playas hacia el interior de bahía o golfos, aunque también evidencian cambios en su morfología, los procesos son más lentos y no requieren aún medidas correctivas. Se discute tanto sobre los distintos procesos océano-meteorológicos que están asociados a los procesos de erosión, como mareas astronómicas y oleajes extraordinarios, el Fenómeno de El Niño y calentamiento global antropogénico. Se relacionan también estos procesos a posibles efectos geodinámicos que han ocurrido, o están ocurriendo, en ambas costas. Nuevos estudios sobre proyecciones del nivel del mar indican un peor escenario en los próximos 100 años, por lo que urge tomar acciones ante el eminente cambio climático antropogénico. Se recomienda un estudio más detallado, playa por playa, que determine el estado erosión o acreción de las mismas, y un monitoreo permanente en algunas zonas donde la erosión es acelerada, especialmente en algunas flechas de arena muy sensibles a los impactos costeros. Pero lo mas importantes es que los entes gubernamentales, relacionados directa o indirectamente con esta problemática, primero acepten que este es un fenómeno que ya se está dando en nuestro país, de manera que se generen los recursos y medidas políticas necesarias para enfrentar el problema, pero que además, se sensibilice a la población sobre los procesos oceánicos que se avecinan.

Most of the beaches of Costa Rica, both on the Pacific including Cocos Island and Caribbean coasts, experiencing erosion processes. Some places on open beaches show more accelerated erosion and require immediate action, while beaches into the bay or gulf, also show changes in morphology, but processes are slower and still do not require further corrective action. It's discuss the ocean-meteorological processes that are associated to erosion, like extraordinary astronomical tides and waves, the phenomenon of El Niño and anthropogenic global warming. Also it's relate to geodynamic processes that have occurred or are occurring on both coasts. New studies on sea-level projections indicate a worse scenario in the next 100 years, so that urgent action before the eminent anthropogenic climate change. We recommend further study, beach by beach, in order to determine the erosion or accretion state, and make monitoring in some areas where erosion is accelerated, especially in some very sensitive coastal impact places like sand spits and barrier islands. But the most important is that government entities, directly or indirectly related to this issue, first accept that this is a phenomenon that is occurring in our country, so as to generate the resources and the necessary policies to address the problem, but also sensitize the public about ocean processes ahead

Se utilizaron los datos batimétricos GEBCO-08 de la UNESCO para estudiar las provincias marinas alrededor de la Isla del Coco. Se analizaron las montañas submarinas que tuvieran menos de 1000m de profundidad en esta cordillera. Montes submarinos localizados al sur, sureste y oeste de la isla, fueron identificados con profundidades de 300m desde la superficie del mar, y con alturas de hasta 2700m desde el fondo marino. La interconexión ecológica con la Isla del Coco de estos montes debe ser efectiva, como lo serán también dentro del corredor biológico del Pacifico Tropical Este. Se realizó un estudio particular de mayor resolución alrededor de la Isla del Coco para identificar los alcances de la plataforma de la isla. Se encontró un monte submarino a 14.8km al noreste de la isla, con profundidades medidas de 30-40m, que no había sido reportado. Con este rasgo submarino se explica la presencia de pescadores alrededor del este sitio, un sitio conocido en el ambiente de los pescadores, pero que aún no se había asociado a algún fenómeno oceánico en particular. Aunque más estudio es necesario, de comprobarse la conectividad biológica entre los montes submarinos y la Isla del Coco, los límites y las políticas ambientales deberán ser modificados, de manera que se proteja adecuadamente este sistema ecológico.

The UNESCO GEBCO-08 bathymetric data was used to study the marine provinces around Isla del Coco. Seamounts with depths of less than 1000m from the sea surface were analyzed. Seamounts southward, south- eastward and westward of the island, were identified at depths of 300m from the sea surface, and with heights up to 2700m from the marine bottom. The ecological interconnection of these mountains with Isla del Coco has to be effective, as it could also be within the biological corridor of Eastern Tropical Pacific. A better resolution study around Isla del Coco was done to identify details of the insular platform. A seamount to 14.8km northeast of the island was found, with measured depths of 30-40m, and so far, not reported. This feature explains the presence of fishermen around this site, which is known by them as a place with high productivity. Although more studies are needed, the limits and environmental policies should be modified so as to adequately protect these seamounts, which probably have an important ecological connection with Isla del Coco. Citation: Lizano, O.G. 2012. Rasgos morfológicos alrededor de la Isla del Coco y de sus montes submarinos vecinos, Pacífico de Costa Rica.

In 2008 and 2009, samples of melon (Cucumis melo L.), watermelon (Citrullus lanatus Thumb), pumpkin (Cucurbita pepo L.), and cucumber (Cucumis sativus L.) plants, as well as specimens of white fly (Bemisia tabaci Genn.) from different regions in the states of Nuevo León, Coahuila and Durango, México, were collected. After RNA isolation, the samples were analyzed by RT-PCR using specific primers to amplify p22, heat shock and capsid proteins, for the cucurbit yellows stunt disorder virus (CYSDV). CYSDV virus was detected in melon, watermelon and white fly collected in several regions. Twenty-six samples turned out to be positive for the CYSDV virus out of 129 Cucurbitaceae plants in the tree states studied of the North-Central of México. The PCR products were cloned and sequenced, and then compared with the available sequences of the GenBank. Sequences obtained from the positive samples had 96 to 100 % of similarity with samples from the United States, Spain and other countries.

Durante los años 2008 y 2009 se muestrearon plantas de melón (Cucumis melo L.), sandía (Citrullus lanatus Thumb), calabacita (Cucurbita pepo L.) y pepino (Cucumis sativus L.), así como especímenes de mosquita blanca (Bemisia tabaci Genn.) en diferentes localidades de los Estados de Nuevo León, Coahuila y Durango. Después de extraer el ARN, las muestras se analizaron con la técnica de RT-PCR, con oligonucleótidos específicos que amplifican regiones conservadas que codifican para las proteínas p22, de choque térmico y la cápside del virus del amarillamiento y enanismo de las cucurbitáceas (CYSDV). Se detectó el virus CYSDV en plantas de melón y sandía, así como mosquita blanca colectada en varias localidades. Se encontraron 26 muestras positivas al virus CYSDV de 129 plantas de la familia Cucurbitaceae en los tres estados estudiados de la región Norte-Centro de México. Los productos de amplificación fueron clonados y secuenciados, y se compararon con las secuencias disponibles en el GenBank. Las secuencias obtenidas a partir de las muestras positivas presentaron de 96 a 100 % de similitud con secuencias de Estados Unidos, España y otros países.

Se propone un método para evaluar enriquecimiento de metales en sedimentos de Bahía Culebra y en el Golfo de Nicoya de Costa Rica a través de la normalización de los elementos y el aluminio usando la regresión lineal de las concentraciones de los elementos y el Aluminio. Las distribuciones de los elementos manganeso y el estroncio de Bahía Culebra no cumplen con las pruebas de normalización y de regresión lineal, indicando una distribución no natural o enriquecimiento de estos elementos en esta región. En el Golfo de Nicoya los elementos cobre, zinc, rubidio y el estroncio no cumplen ya sea con la hipótesis de normalidad o con la regresión lineal respecto al aluminio, indicando un posible enriquecimiento de estos elementos en esta región. La mayoría de las concentraciones de los elementos tanto en ambos sitios de muestreo, con excepción del cromo, se encuentran dentro de los ámbitos naturales encontrados en las rocas o en las arcillas de sedimentos marinos a nivel mundial, y dentro de los ámbitos de las concentraciones de otros estudios realizados en estas mismas regiones. El cromo muestra valores promedio más allá de las concentraciones naturales, siendo la concentración de algunas muestras en el Golfo de Nicoya hasta diez veces mayores que el valor de una bahía con alta contaminación de este elemento.

A method to evaluate metal enrichment in marine sediments. In order to evaluate metal enrichment in sediments , a method is proposed and tested in Bahia Culebra and the Golfo de Nicoya, Costa Rica through the normalization of the elements against aluminum, and by linear regression of the logarithm of the concentrations of different elements respect to aluminum. The distributions of the elements manganese, and strontium of Bahía Culebra did not satisfy the tests of normalization and linear regression, indicating a nonnatural distribution or enrichment of these elements in this region. In the Golfo de Nicoya the elements copper , zinc , rubidium and the strontium did not satisfy the test of normality or the linear regression with respect to aluminum, indicating a possible enrichment of these elements. The majority of the concentrations of the elements in two sample sites, with the exception of chromium, are within the natural ranges in rocks or clays of marine sediments, and within the concentration ranges of other studies done in these same regions. Chromium has average values beyond the natural concentrations, the values of some samples in the Golfo de Nicoya are up to 10 times greater than the concentration value of a typical bay with high contamination of this element.